正确的维护管理和使用是保证洁净室洁净度的关键环节，须建立严格的规章制度，空气净化系统应按规定清洁、维修、保养并作记录。
每日检查1次，保持内部干净。初效滤网每2周清洗1次，初效过滤器每3～6个月更换；
中效过滤器每周检查1次，6～12个月更换；亚高效过滤器1年以上更换1次；
高效过滤器1年检查1次，当阻力超过设计阻力160Pa或已经使用3年以上时应予以更换。
排风机组中的中效、高效过滤器，每年更换。如实施特殊污染手术，每做1例手术必须更换，换下的过滤器必须密封运出，焚烧处理。
吊顶送风天花应每月检查1次，并清洁内部表面（阻漏式天花除外）。
回风口过滤器要定期检查，每年更换1次，如实施特殊污染手术，每做1例手术必须更换，密封取出焚烧，并用消毒液擦拭回 风口内外表面。若做一般污染手术，每做1例手术后必须立即使用消毒液消毒并进行彻底清洗。
回风口栅栏每日用消毒液清洁表面，每周将过滤网清洗1次。
每日术前、术中及术后检查和记录洁净手术间静压差、风速、温度、湿度。
